Pada awal seri, Shinichi adalah seorang detektif yang cukup terkenal sekolah tinggi yang sering membantu polisi memecahkan misteri pembunuhan Tokyo.

Suatu hari, Shinichi Ran membawa temannya ke sebuah taman tema lokal bernama "Tropical Land", untuk merayakan kemenangannya di Kejuaraan Karate Metropolitan. Dia kemudian akhirnya memecahkan kasus pembunuhan ada [3] Karena mereka meninggalkan., Shinichi kepala sendirian untuk mengikuti orang yang mencurigakan di Vodka hitam,, yang tersangka dalam pembunuhan sebelumnya. Shinichi saksi suatu pemerasan pertukaran antara Vodka dan presiden perusahaan di daerah terpencil di luar taman, tapi terlalu asyik untuk memperhatikan Gin, Vodka's partner, menyelinap dari belakang. Gin mengetuk dia keluar dan memaksa dia untuk menelan racun percobaan baru yang dikenal sebagai APTX 4869, dan mereka kemudian meninggalkan dia untuk mati. Namun, daripada membunuh Shinichi, efek samping jarang terjadi: tubuhnya menyusut ke dalam dari enam tahun diri [4] Setelah keluar dari keamanan parkir yang bermaksud baik tapi skeptis, dengan tempat lain untuk pergi Shinichi kepala rumah.. Dia ada berjalan ke tetangga sebelah dan teman keluarga dekat, Dr Hiroshi Agasa, yang memperingatkan dia bahwa ia harus menjaga rahasia identitas karena Organisasi Hitam akan membunuh dirinya dan orang lain yang berhubungan dengan dia harus mereka menemukan kebenaran. [5]